Ειδικότερα, αντιμετωπίζονται οι παρακάτω παθήσεις:

1. Παθήσεις των πνευμόνων

• Καρκίνος του πνεύμονα
• Πνευμονικοί όζοι
• Μεταστάσεις στον πνεύμονα
• Καρκινοειδείς όγκοι
• Αμαρτώματα και άλλοι καλοήθεις όγκοι
• Βρογχεκτασίες
• Πνευμονικά αποστήματα
• Συγγενείς ανωμαλίες (π.χ. πνευμονική sequestration, CPAM)
• Εμφύσημα (σε επιλεγμένους ασθενείς για LVRS)
• Γιγαντιαίες πνευμονικές φυσσαλίδες

2. Παθήσεις του μεσοθωρακίου

• Θυμώματα και θυμικά καρκινώματα
• Κύστεις μεσοθωρακίου
• Νευρογενείς όγκοι
• Τερατώματα και άλλοι όγκοι γεννητικών κυττάρων
• Λοιποί όγκοι του πρόσθιου, μέσου και οπίσθιου μεσοθωρακίου

3. Παθήσεις του υπεζωκότα

• Πλευριτικές συλλογές
• Εμπύημα
• Κακοήθης πλευριτική συλλογή
• Μεσοθηλίωμα
• Πνευμοθώρακας
• Αιμοθώρακας

4. Παθήσεις του θωρακικού τοιχώματος

• Όγκοι πλευρών και στέρνου
• Παραμορφώσεις:
  • Pectus excavatum
  • Pectus carinatum
• Σύνδρομο Slipping Rib
• Μετατραυματικές παραμορφώσεις
• Χρόνιος πόνος του θωρακικού τοιχώματος (σε επιλεγμένες περιπτώσεις)

5. 5. Τραύμα θώρακος

• Κατάγματα πλευρών
• Flail chest
• Αιμοπνευμοθώρακας
• Τραυματικές ρήξεις πνεύμονα
• Σταθεροποίηση καταγμάτων πλευρών (SSRF)

6. Παθήσεις τραχείας και βρόγχων

• Στενώσεις τραχείας
• Καλοήθεις και κακοήθεις όγκοι τραχείας
• Τραχειοβρογχικά συρίγγια
• Τραυματισμοί τραχείας

7. Διαφραγματικές παθήσεις

• Παράλυση διαφράγματος
• Διαφραγματοκήλες
• Ρήξη διαφράγματος
• Eventration διαφράγματος

8. Υπεριδρωσία

• Πρωτοπαθής υπεριδρωσία παλαμών, μασχαλών ή προσώπου
• Αντιμετώπιση με ενδοθωρακική συμπαθεκτομή (ETS)

9. Διαγνωστικές επεμβάσεις

• Βιοψίες πνεύμονα
• Βιοψίες υπεζωκότα
• Βιοψίες μεσοθωρακίου
• Θωρακοσκόπηση (VATS)
• Mediastinoscopy
• Συνδυασμένες επεμβάσεις με επεμβατική πνευμονολογία (π.χ. υβριδικές τεχνικές)